1．自然界是否存在五种以上的基本作用力？
2．基本物理常数的数值会随时间改变吗？
3．自然界的基本常数为什么具有现在的数值？
4．引力能否被屏蔽？
5．负引力存在吗？
6．宇宙中不断有物质创生吗？
7．引力子，你在何方？
8．新以太是否存在？
9．为什么时间具有方向性？
10．宇宙时是不均匀时间流吗？
11．为什么物理学的基本方程都具有时间反演不变性？
12．为什么绝对零度不可达到？
13．为什么热水比冷水冻结快些（Erasto Mpemba问题）？
14．运动物体的温度会改变吗？
15．开放系统的熵具有什么物理意义？
16．湍流形成的机理是什么？
17．地球磁场极性颠倒的原因是什么？
18．南极空洞是怎么形成的？
19．生物体内有核反应吗？
20．地球外有智慧生物吗？
21．地震前的地光是怎么形成的？
22．为什么闪电多‘之’字形少球形？
23．自然界是否存在七种对称性晶体？
24．能否解决强关联多电子系统的基态和元激发问题？
25．能否解决低维凝聚态物理新现象的理论问题？
26．何时能揭开狄拉克的大数之谜？
27．可观测宇宙的空间有多大？
28．宇宙中的暗物质是由什么粒子构成的？
29．为什么宇宙中反物质如此少？
30．反物质世界存在吗？
31．反物质能源能否实现？
32．可控轻核聚变能否实现？
33．激光热核反应的点火条件（劳森判据）能否达到？
34．常温核聚变能否实现？
35．冷核聚变能否实现？
36．薛定谔的猫是死还是活？
37．EPR之谜能否解决？
38．量子混沌确实存在吗？
39．高温超导的微观机理是什么？
40．可否发现室温超导体？
41．最后一个超重元素的质子数是多少？
42．热中子辐射俘获疑问的实质是什么？
43．原子核磁矩能否准确计算出来？
44．Gamow-Teller巨共振问题gA（核内核子）!=gA（自由核子）能否解决？
45．奇异电子峰是怎样形成的？
46．EMC效应能否解决？
47．质子自旋危机能否解决？
48．电子与核散射中，纵向响应形状因子问题能否解决？
49．有限核的结合能与能极能否一一准确算出来？
50．夸克－胶子等离子体（QGP）物质态是否真的存在？
51．双生子佯谬能否解决？
52．穿洞佯谬能否解决？
53．滑落佯谬能否解决？
54．柔绳佯谬能否解决？
55．直角杠杆佯谬能否解决？
56．静止长度上限佯谬能否解决？
57．运动物体视在形象佯谬能否解决？
58．长度缩短的应力效应佯谬能否解决？
59．超光速佯谬能否解决？
60．快子佯谬能否解决？
61．奥本海默佯谬能否解决？
62．奥伯斯佯谬能否解决？
63．宇宙种子磁场的来历是什么？
64．太阳中微子之谜能否解决？
65．中微子有无静止质量？
66．有无中微子振荡？
67．类星体的能源是什么？
68．黑洞何时可以露真容？
69．磁单极是否存在？
70．Higgs粒子是否存在？
71．质量的起源是什么？
72．真正的对称自发破损的机理是什么？
73．自由夸克能否直接在实验中被发现？
74．有无胶子球存在？
75．轴子，畴壁能否找到？
76．存在第四代基本粒子吗？
77．CP不守恒难题只能在中性K介子衰变中见到吗？
78．引起CP对称性破坏的力是什么？
79．e-u-t之谜何时能解开？
80．亚夸克结构仅仅是推测吗？
81．质子的寿命有多长？
82．电子有无结构？
83．光子有无结构？
84．真空的本质是什么？
85．有无奇异物质存在？
86．C，Ψ物理中的ρπ疑难能否解决？
87．是否存在中性，稳性，质量至少大于40GeV的超对称粒子？
88．究竟有无超弦？
89．虫洞究竟有没有？
90．时间机器能造出来吗？
91．引力能否用量子理论加以描述？
92．能否将引力和其他几种基本力统一起来？
93．自然界手征不对称起源的关键是什么？
94．宇宙会一直膨胀下去吗？
95．宇宙大爆炸的量子起源是什么？
96．大爆炸之前可能存在什么？
97．我们的宇宙是否有兄弟姐妹？